dijous, 11 de febrer del 2016

DNA EXTRACTION

Introduction

-Deoxyribonucleic acid (DNA) is a nucleic acid that encodes the genetic instructions used in the development and functioning of all known living organisms and many viruses.
-Nucleic acids are biopolymers formed by simple units called nucleotides. Each nucleotide is composed of a nitrogen-containing nucleobase (G, T, C, A) as well as a monosaccharide and a phospate group.
-These nucleotides are joined to one another in a chain by covalent bonds between the sugar of one nucleotide and the phosphate of the next.


Materials

- 1L Erlenmeyer flask
- 100mL beaker
- 10mL graduated cylinder
- Small funnel
- Glass stirring rod
- 10mL Pipet
- Knife
- Safety goggles
- Cheesecloth

- Kiwi
- Banana
- Pineapple juice (1mL / 5mL)
- Distilled Water
- 90% Ethanol ice-cold
- 7mL DNA buffer
  50mL dish soap
  15g NaCl
  900mL tap water


Objectives


  1. Study the DNA structure
  2. Understand the process of extracting DNA from a tissue


Procedure

Put the ethanol in the freezer, we will need it really cold later.

- Prepare the buffer in a 0'5L beaker: Add 450mL of tap water, 25mL of a dish soap and 7g NaCl. Stir the mixture.

























1. Peel the kiwi/banana and chop it to small pieces. Place the pieces of the kiwi in one 600mL beaker and smash with a fork until it becomes a juice puree. 

2. Add 8mL of buffer to the beaker. 

3. Later mash the kiwi/banana puree carefully for 1 minute without creating many bubbles. 

4. Finally filter the mixture: put the funnel on top of the graduated cylinder. Place the cheesecloth on top of the funnel. 










5. Add beaker contain carefully on top of the cheesecloth to fill the graduated cylinder. The juice will drain through the chessecloth but the chucks of kiwi/banana will not pass through into the graduated cylinder. 

6. Add the pineapple juice to the green juice (1mL of pineaplle juice to 5mL of DNA solution). This step will help us to obtain a purer solution of DNA. 

7. Tilt the graduated cylinder and pour in a equal amount of ethanol witg an automatic pipet. Put the ethanol through the sides of the graduated cylinder very carefully. You will need about equal volumes of DNA solution to ethanol. 


(Dania's blog photo)





8. Place the graduated cylinder so that it is eye level. Using the stirring rod, collect DNA at the boundary of ethanol and kiwi/banana juice. Do not stir the kiwi juice; only stir in the above ethanol layer. 

9. The DNA precipitate looks like long, white and thin fibers. 

10. Gently remove the stirring rod and examine what DNA looks like. 











RESULTS






QUESTIONS
1. Like a gelatine, white
2. To brake the cells, it's located in the cell wall
3. We add salt to brake the cells and soap to clean the proteins. Papaine cleans and delete the proteins.
4. It's a good method to catch it because the DNA goes to ethanol.







DETERMINACIÓ DE LA COMPOSICIÓ DE LA LLET (CASEÏNA, ALTRES PROTEÏNES, MIDÓ I GLÚCIDS REDUCTORS, PRESÈNCIA DE LÍPIDS)

Determinació de la llet

La llet conté vitamines, minerals, proteïnes, glúcids i lípids.
En aquesta pràctica identificarem tots aquests components i per tant serà un resum de totes les pràctiques d'identificació que hem realitzat al llarg del curs.


1.Determinació de la caseïna
La caseïna és una proteïna conjugada del tipus fosfoproteïna que se separa de la llet per acidificació i forma una massa blanca. Les fosfoproteïnes són un grup de proteïnes que es troben químicament unides a àcid fosfòric. La caseïna representa entre 77 i el 82% de les proteïnes presents a la llet. Aquesta proteïna presenta una baixa solubilitat (pH 4,6). En la primera part del experiment aïllareu la caseïna.

1- Afegim 200ml de llet en un vas de precipitats i l'escalfem fins 40 graus aproximadament.
2- El treiem del foc i afegim gota a gota àcid acètic (1ml d'àcid acètic glacial en 10 ml d'aigua destil.lada) amb un comptagotes. Agitem amb una vareta de vidre fins que acabi de precipitar tota la caseïna. (No afegir massa àcid acètic)

1                                           2


3- Separem la caseïna amb l'ajuda d'una espàtula i la posem en un vidre de rellotge. I posem-lo assecar en la placa calenta.
4- Afegim immediatament en el líquid que ens ha quedat 4 gr de carbonat de calci en pols. L'agitem al llarg d'uns minuts i el guardem per la següent part. Això és el sèrum de la llet.
5- Quan la caseïna hagi perdut l'aigua calculem el percentatge de caseïna aïllada sabent que la densitat de la llet és 1,03 g/ml.



5                                                  






                                                                   4

  4









2-Determinació d'altres proteïnes
Determinem la presència d'altres proteïnes en l'extracte (sèrum) de la pràctica anterior mitjançant la prova de Biuret. 
- 2ml de sèrum 
- 2ml d'hidròxid de sodi
- 5 gotes de sulfat de coure 









3- Determinació de midó i glúcids reductors
1.Determinem si la llet conté midó en el producte que hem extret (sèrum) de la pràctica anterior. 
2.Determinar la presència de glúcids reductors. 
- Petita quantitat de sèrum + lugol 
- Sudan III 























4- Determinació de la presència de lípids:
1.Determinem la presència de lípids de la llet en un tub d'assaig amb 2ml de llet. 
2.Al final afegim 1ml d'HCL al 50% al tub d'assaig anterior i l'escalfem suaument, finalment anotem els resultats que observem.
3.Provem-lo també amb el sèrum de la llet de la pràctica 1. 

- 2ml fehling A/B 







TAULA AMB ELS RESULTATS